Strain

Poland_Pol16_20540_o10_2016-2017 (Region: Poland;  Strain: Pol16_20540_o10;  Date: 2016-2017)

Gene

pCP204L

Description

With frameshift mutation but translatable,  pCP204L

Location

MG939585.1(-):124824-125408

GenBank Accession

AIY22442.1

Full name

Phosphoprotein p30      

Alternative Name

p32
Phosphoprotein p32

CDS

ATGGATTTTATTTTAAATATATCCATGAAAATGGAGGTCATCTTCAAAACGGATTTAAGATCATCTTCACAAGTTGTGTTTCATGCGGGTAGCCTGTATAATTGGTTTTCTGTTGAGATTATCAATAGCGGTAGAATTGTTACGACCGCTATAAAAACATTGCTTAGTACTGTTAAGTATGATATTGTGAAATCTGCTCGTATATATGCAGGGCAAGGGTATACTGAACATCAGGCTCAAGAAGAATGGAATATGATTCTGCATGTGCTGTTTGAAGAGGAGACGGAATCCTCAGCATCTTCGGAGAACATTCATGAAAAAAATGATAATGAAACCAATGAATGCACATCCTCCTTTGAAACGTTGTTTGAGCAAGAGCCCTCATCGGAGGTACCTAAAGACTCCAAGCTGTATATGCTTGCACAAAAGACTGTGCAACATATTGAACAATATGGAAAGGCACCTGATTTTAACAAGGTTATTAGAGCACATAATTTTATTCAAACCATTTATGGAACCCCTCTAAAGGAAGAAGAAAAAGAGGTGGTAAGACTCATGGTTATTAAACTTTTAAAAAAAAAATAA

Protein

MDFILNISMKMEVIFKTDLRSSSQVVFHAGSLYNWFSVEIINSGRIVTTAIKTLLSTVKYDIVKSARIYAGQGYTEHQAQEEWNMILHVLFEEETESSASSENIHEKNDNETNECTSSFETLFEQEPSSEVPKDSKLYMLAQKTVQHIEQYGKAPDFNKVIRAHNFIQTIYGTPLKEEEKEVVRLMVIKLLKKK

Function

Modifies the subcellular distribution of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K (HNRNPK) and may contribute to modulate HNRNPK functions related to processing and export of mRNAs during ASFV infection.

Subunit

Oligomer. Interacts with host HNRNPK (By similarity).
Oligomer. Interacts with host HNRNPK.

Miscellaneous

Most abundantly expressed viral protein early in infection.

Similarity

Belongs to the asfivirus phosphoprotein p30 family.

Keywords

Early protein   Host cytoplasm   Host nucleus   Host-virus interaction   Phosphoprotein   Complete proteome   Reference proteome  

Feature

chain  Phosphoprotein p30

Uniprot

A9JLY8   D4I5T0   Q71M22   P29999   A0A386RUP9   A0A386RV53   + More
A0A0A1DY68   Q8V1E7   P34204   A0A386RVH7   B9UNE5   E0WM43   X2KZ00   A0A386RV57   B9UND4   A0A0C5B2M7   W5RPR2   A0A0C5B276   B9UN86   B9UN88   P0C9Z2   M4ISI9   M4GXE4   M4GWS6   A9JL56   B9UN96   B9UNE6   M4IUA4   M4GWS8   M4GXZ7   M4JCE7   B9UNA3   B9UN94   B2RGL3   A0A286T4I8   A0A2Z6BDM6   A0A386IQM1   M4GXF7   R4S7G0   B9UNA4   R4RU05   B9UND6   B9UNC5   P0C9Z4   A0A286T245   A0A286T231   A0A286T502   A0A286T4Y9   A0A286T537   A0A286T230   A0A286T239   B2MUN4   B2MUN2   B2MUN3   B2MUN1   B9UNC3   M4GZ07   B9UNC0   B9UNB2   M4JCE3   B9UNA9   M4GX43   R4S7I5   B9UN95   P0C9Z3   M4IU98   M4GWR6   M4JE35   B9UND5   X2CUL3   R4RWC9   B9UN92   R4RWE1   R4S3W1   B9UNB5   A0A2Z6BDM8   A0A286T5A8   B9UND1   X2CV36   B9UN84   B9UND3   B9UNB9   A0A286T4M5   B9UNB8   E5G1E2   E5G1E1   E5G1E3   B9UNB7   B9UN85   B9UNB4   B9UNC9   B9UNC6   P0C9Z1   E5G1E7   E5G1E6   E5G1E5   X2CTK9   E5G1E0   E5G1C7  

Pubmed

18198370    25406173    26618713    27174805    1604821    8474154    + More
11831707    18775702    21470447    25645905    20965989   

EMBL

AM712240    CAN10442.1    FN557520    CBH29193.1    AF462271    AF462272    + More
KM262844    KP055815    KT718736    KT718737    KT718738    KT718739    KT718740    KT718741    KT718742    KT718743    KT718744    KT718745    KT718746    KT718747    KT718748    KT718749    KT718750    KT718751    KT718752    KT718753    KT718754    KT718755    KT718756    KT718757    KT718758    KT718759    KT718760    KT718761    KT718762    KT718763    KT718764    KX354450    AAL68655.1    AAL68656.1    AIY22284.1    AKO62774.1    AMA19551.1    AMA19552.1    AMA19553.1    AMA19554.1    AMA19555.1    AMA19556.1    AMA19557.1    AMA19558.1    AMA19559.1    AMA19560.1    AMA19561.1    AMA19562.1    AMA19563.1    AMA19564.1    AMA19565.1    AMA19566.1    AMA19567.1    AMA19568.1    AMA19569.1    AMA19570.1    AMA19571.1    AMA19572.1    AMA19573.1    AMA19574.1    AMA19575.1    AMA19576.1    AMA19577.1    AMA19578.1    AMA19579.1    AOO54442.1    M88336    MG596479    AYE67030.1    MG596476    AYE67027.1    KM262845    AIY22442.1    AF462274    MG596469    MG596470    MG596471    MG596472    MG596473    MG596474    MG596477    MG596478    MG596480    MG596481    MG596483    MG596484    MG596485    MG596487    MG596488    MG596489    MG596490    MG596491    MG596492    MG596493    MG596494    MG596495    MG596496    MG596497    MG596498    AAL68658.1    AYE67020.1    AYE67021.1    AYE67022.1    AYE67023.1    AYE67024.1    AYE67025.1    AYE67028.1    AYE67029.1    AYE67031.1    AYE67032.1    AYE67034.1    AYE67035.1    AYE67036.1    AYE67038.1    AYE67039.1    AYE67040.1    AYE67041.1    AYE67042.1    AYE67043.1    AYE67044.1    AYE67045.1    AYE67046.1    AYE67047.1    AYE67048.1    AYE67049.1    M96354    U18466    MG596475    AYE67026.1    EU874316    MG939583    MG939587    MG939588    LS478113    ACJ61575.1    AXZ95867.1    AXZ96055.1    AXZ96150.1    SPS73516.1    FR682468    CBW46759.1    KJ195684    AHN94305.1    MG596482    MG596486    AYE67033.1    AYE67037.1    EU874305    ACJ61564.1    KM111295    MH025916    MH025917    MH025918    MH025919    MH025920    AJL34271.1    AXB49321.1    AXB49495.1    AXB49667.1    AXB49838.1    AXB50011.1    KC535547    AHA58712.1    KM111294    AJL34106.1    EU874257    EU874260    EU874261    KC535546    KF736437    ACJ61516.2    ACJ61519.1    ACJ61520.1    AHA58711.1    AHA58916.1    EU874258    EU874259    EU874262    ACJ61517.1    ACJ61518.2    ACJ61521.2    AY261361    JQ764953    JQ764954    JQ745044    JQ745046    KC867515    AFH57828.1    AFH57829.1    AGA54110.1    AGA54112.1    AHA58751.1    JQ764941    JQ764942    JQ764943    JQ764944    JQ764945    JQ764946    AFH57816.1    AFH57817.1    AFH57818.1    AFH57819.1    AFH57820.1    AFH57821.1    JQ764950    AFH57825.1    AM712239    CAN10192.1    EU874267    EU874268    EU874269    EU874270    EU874271    EU874272    EU874273    EU874277    EU874282    EU874293    JQ764926    JQ764927    JQ764928    JQ764929    JQ764930    JQ764931    JQ764932    JQ764933    JQ764934    JQ764935    JQ764936    JQ764937    JQ764939    JQ764940    JQ764947    JQ764948    JQ764951    JQ764952    JQ745034    JQ745039    JQ745042    JQ745043    JQ745045    JQ745047    JQ794837    JQ794841    JQ745012    KC535548    KC867506    KC867507    KC867509    KC867510    KC867527    KC662395    KC662396    KM102979    ACJ61526.1    ACJ61527.1    ACJ61528.1    ACJ61529.1    ACJ61530.1    ACJ61531.1    ACJ61532.1    ACJ61536.1    ACJ61541.1    ACJ61552.2    AFH57802.1    AFH57803.1    AFH57804.1    AFH57805.1    AFH57806.1    AFH57807.1    AFH57808.1    AFH57809.1    AFH57810.1    AFH57811.1    AFH57812.1    AFH57813.1    AFH57814.1    AFH57815.1    AFH57822.1    AFH57823.1    AFH57826.1    AFH57827.1    AGA54100.1    AGA54105.1    AGA54108.1    AGA54109.1    AGA54111.1    AGA54113.1    AGA54115.1    AGA54119.1    AGC24343.1    AHA58713.1    AHA58742.1    AHA58743.1    AHA58745.1    AHA58746.1    AHA58763.1    AHA58930.1    AHA58931.1    AJZ77136.1    EU874317    ACJ61576.1    JQ745041    AGA54107.1    JQ764955    AFH57830.1    JQ764949    AFH57824.1    JQ745011    AGC24342.1    EU874274    EU874315    JQ764915    JQ764916    JQ764917    JQ764918    JQ764919    JQ764920    JQ764921    JQ764922    JQ764923    JQ764924    JQ764925    JX139113    JX139114    JX139115    JX139116    KC867503    KF736446    ACJ61533.2    ACJ61574.2    AFH57791.1    AFH57792.1    AFH57793.1    AFH57794.1    AFH57795.1    AFH57796.1    AFH57797.1    AFH57798.1    AFH57799.1    AFH57800.1    AFH57801.1    AGA62473.1    AGA62474.1    AGA62475.1    AGA62476.1    AHA58739.1    AHA58923.1    EU874265    JQ745024    ACJ61524.2    AGC24355.1    AM999766    CAQ53725.1    LC213615    BBA26288.1    LC322014    BBD14108.1    MH735141    AYD60222.1    JQ764909    JQ764957    JQ764958    JQ764959    JQ764960    JQ764961    JQ764962    JQ764963    JQ764964    JQ764965    JQ745033    JQ794838    JQ794839    JX524222    JQ744997    JQ745004    JQ745016    JQ745017    KC867519    KC662397    AFH57786.1    AFH57831.1    AFH57832.1    AFH57833.1    AFH57834.1    AFH57835.1    AFH57836.1    AFH57837.1    AFH57838.1    AFH57839.1    AGA54099.1    AGA54116.1    AGA54117.1    AGA62525.1    AGC24328.1    AGC24335.1    AGC24347.1    AGC24348.1    AHA58755.1    AHA58932.1    KC610547    AGL93206.1    EU874275    ACJ61534.1    KC610541    KC610542    KC610545    KC610548    KC610549    KC610550    KC610551    KC610552    KC610553    KC610554    KC610556    AGL93200.1    AGL93201.1    AGL93204.1    AGL93207.1    AGL93208.1    AGL93209.1    AGL93210.1    AGL93211.1    AGL93212.1    AGL93213.1    AGL93215.1    EU874307    EU874308    ACJ61566.1    ACJ61567.1    EU874264    EU874276    EU874296    EU874309    EU874310    EU874311    EU874313    EU874314    JQ764913    ACJ61523.2    ACJ61535.2    ACJ61555.1    ACJ61568.1    ACJ61569.1    ACJ61570.2    ACJ61572.1    ACJ61573.1    AFH57790.1    AY261366    LC213610    BBA26283.1    LC213618    BBA26291.1    LC213616    BBA26289.1    LC213613    BBA26286.1    LC213614    BBA26287.1    LC213617    BBA26290.1    LC213609    BBA26282.1    EU620689    ACC95846.1    EU620687    ACC95844.1    EU620688    ACC95845.1    EU620686    ACC95843.1    EU874294    ACJ61553.1    JQ764910    AFH57787.1    EU874291    EU874312    JQ764893    JQ764894    JQ764896    JQ764897    JQ764898    JQ764899    JQ764901    JQ764906    JQ764911    JQ764912    JQ745035    JQ745037    JQ745040    JQ744998    JQ745002    JQ745019    JQ745021    JQ745022    JQ745023    ACJ61550.2    ACJ61571.2    AFH57770.1    AFH57771.1    AFH57773.1    AFH57774.1    AFH57775.1    AFH57776.1    AFH57778.1    AFH57783.1    AFH57788.1    AFH57789.1    AGA54101.1    AGA54103.1    AGA54106.1    AGC24329.1    AGC24333.1    AGC24350.1    AGC24352.1    AGC24353.1    AGC24354.1    EU874279    EU874281    EU874283    EU874284    JQ764895    JQ794840    ACJ61538.2    ACJ61540.2    ACJ61542.2    ACJ61543.2    AFH57772.1    AGA54118.1    JQ764907    JQ764908    JQ745038    JQ794836    JQ745001    JQ745003    JQ745005    JQ745010    JQ745015    KC867505    KC867526    AFH57784.1    AFH57785.1    AGA54104.1    AGA54114.1    AGC24332.1    AGC24334.1    AGC24336.1    AGC24341.1    AGC24346.1    AHA58741.1    AHA58762.1    EU874280    JQ764902    JQ764904    JQ764905    JQ745014    JQ745018    ACJ61539.2    AFH57779.1    AFH57781.1    AFH57782.1    AGC24345.1    AGC24349.1    JQ764966    JQ764967    JQ745036    KC867518    AFH57840.1    AFH57841.1    AGA54102.1    AHA58754.1    KC610543    KC610544    AGL93202.1    AGL93203.1    EU874266    EU874278    EU874295    JQ764900    JQ745013    ACJ61525.1    ACJ61537.1    ACJ61554.1    AFH57777.1    AGC24344.1    AY261363    JQ745031    AGA54097.1    JQ764903    KC662394    AFH57780.1    AHA58929.1    JQ744999    JQ745006    JQ745007    JQ745008    JQ745009    KC867500    KC867501    AGC24330.1    AGC24337.1    AGC24338.1    AGC24339.1    AGC24340.1    AHA58736.1    AHA58737.1    EU874306    ACJ61565.1    KC867523    AHA58759.1    KC610540    AGL93199.1    EU874263    ACJ61522.1    KC610555    AGL93214.1    KC610546    AGL93205.1    EU874286    ACJ61545.1    LC322010    BBD14104.1    LC213611    BBA26284.1    EU874302    ACJ61561.1    KC867511    AHA58747.1    EU874255    ACJ61514.1    EU874304    ACJ61563.1    EU874290    ACJ61549.1    LC213612    BBA26285.1    EU874289    ACJ61548.1    HM745387    ADQ44030.1    HM745386    ADQ44029.1    HM745388    ADQ44031.1    EU874288    KC867522    ACJ61547.2    AHA58758.1    EU874256    JQ764892    JQ745025    JQ745026    JQ745027    JQ745028    JQ745029    JQ745030    JQ745000    JQ745020    KC535545    KC867504    KC867513    KC867517    KC867524    KF736438    KF736441    ACJ61515.2    AFH57769.1    AGA54091.1    AGA54092.1    AGA54093.1    AGA54094.1    AGA54095.1    AGA54096.1    AGC24331.1    AGC24351.1    AHA58710.1    AHA58740.1    AHA58749.1    AHA58753.1    AHA58760.1    AHA58917.1    AHA58920.1    EU874285    JQ764882    JQ764883    JQ764884    JQ764885    JQ764886    JQ764887    JQ764888    JQ764889    JQ764890    JQ764891    KC867508    KC867514    KC867516    KC867520    KF736439    KF736440    KF736442    ACJ61544.1    AFH57759.1    AFH57760.1    AFH57761.1    AFH57762.1    AFH57763.1    AFH57764.1    AFH57765.1    AFH57766.1    AFH57767.1    AFH57768.1    AHA58744.1    AHA58750.1    AHA58752.1    AHA58756.1    AHA58918.1    AHA58919.1    AHA58921.1    EU874300    JQ764845    JQ764846    JQ764847    JQ764848    JQ764849    JQ764850    JQ764851    JQ764852    JQ764853    JQ764854    KC867512    ACJ61559.2    AFH57725.1    AFH57726.1    AFH57727.1    AFH57728.1    AFH57729.1    AFH57730.1    AFH57731.1    AFH57732.1    AFH57733.1    AFH57734.1    AHA58748.1    EU874297    EU874301    JQ764855    ACJ61556.1    ACJ61560.1    AFH57735.1    AY261360    HM745392    ADQ44035.1    HM745391    ADQ44034.1    HM745390    ADQ44033.1    KC867502    AHA58738.1    HM745385    ADQ44028.1    HM745372    ADQ44015.1   

Proteomes

UP000108903    UP000101090    UP000142390    UP000241813    UP000266411    UP000110401    + More
UP000000624    UP000141072    UP000101566    UP000105860    UP000000860    UP000130745    UP000117635    UP000000858    UP000000859    UP000000861   

PRIDE

P29999    P34204    P0C9Z3   

ProteinModelPortal

A9JLY8   D4I5T0   Q71M22   P29999   A0A386RUP9   A0A386RV53   + More
A0A0A1DY68   Q8V1E7   P34204   A0A386RVH7   B9UNE5   E0WM43   X2KZ00   A0A386RV57   B9UND4   A0A0C5B2M7   W5RPR2   A0A0C5B276   B9UN86   B9UN88   P0C9Z2   M4ISI9   M4GXE4   M4GWS6   A9JL56   B9UN96   B9UNE6   M4IUA4   M4GWS8   M4GXZ7   M4JCE7   B9UNA3   B9UN94   B2RGL3   A0A286T4I8   A0A2Z6BDM6   A0A386IQM1   M4GXF7   R4S7G0   B9UNA4   R4RU05   B9UND6   B9UNC5   P0C9Z4   A0A286T245   A0A286T231   A0A286T502   A0A286T4Y9   A0A286T537   A0A286T230   A0A286T239   B2MUN4   B2MUN2   B2MUN3   B2MUN1   B9UNC3   M4GZ07   B9UNC0   B9UNB2   M4JCE3   B9UNA9   M4GX43   R4S7I5   B9UN95   P0C9Z3   M4IU98   M4GWR6   M4JE35   B9UND5   X2CUL3   R4RWC9   B9UN92   R4RWE1   R4S3W1   B9UNB5   A0A2Z6BDM8   A0A286T5A8   B9UND1   X2CV36   B9UN84   B9UND3   B9UNB9   A0A286T4M5   B9UNB8   E5G1E2   E5G1E1   E5G1E3   B9UNB7   B9UN85   B9UNB4   B9UNC9   B9UNC6   P0C9Z1   E5G1E7   E5G1E6   E5G1E5   X2CTK9   E5G1E0   E5G1C7  

KEGG

vg:22220322    

GO

GO:0030430  C:host cell cytoplasm
GO:0042025  C:host cell nucleus
GO:0016032  P:viral process

From MSLVP

Host nucleus. Host cytoplasm.

From Uniprot

Host cytoplasm  
Host nucleus  

Length:

194

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.1471

Exp number, first 60 AAs:

0.14686

Total prob of N-in:

0.09781

outside

1  -  194

 

 

Pi

0.0498902

Theta

0.0591637

Tajima's D

-0.4014802

CLR

0.127626

Interpretation

No evidence of Selection